育珠蚌种类单一，多代近亲繁殖，种质退化严重
日本用于淡水珍珠养殖的蚌源品种，主要是池蝶贝(与我国的三角帆蚌为同属不同种)，基本淘汰了乌贝。池蝶贝主要品质标优于三角帆蚌，不仅个体大、双壳高鼓，而且珍珠层厚。珍珠层平均比三角帆蚌厚1/3，外套膜亦比三角帆蚌厚1/2。因此池蝶贝所产珍珠颗粒普遍大而圆整。
近年来，我国虽然千方百计进行了池蝶贝的引种繁育工作，但因种种因素，至今未能批量繁育并投产，育珠蚌种类单一。我国虽然淘汰了摺纹冠蚌这一劣质蚌源，但由于三角帆蚌自然资源日益减少，而大量生产所用的是人工繁育的蚌源，由于多代近亲繁殖，品种退化严重，影响了高品位、大颗粒珍珠的产出。随着养殖规模的不断扩大，以及蚌源的地区互换，而且又缺乏一定的检疫措施，因而特别是南方养蚌地引起疾病流行，危害甚广，广种薄收仍是育珠生产的主要方式。
养殖生产缺乏规范性管理
淡水珍珠养殖没有较为准确的标准，养殖者大多是农村个体户，规模小，设备落后，养殖技术水平很不一致，生产周期长短不一，因而单位育珠蚌的产珠量和优质珍珠的数量各地悬殊很大，育珠的经济效益很不一致。高密度养殖、环境污染严重、蚌病频发，使淡水养殖受到限制，质量难以提高。各种形状、大小和光泽的淡水珍珠大量涌入市场，供大于求，导致了淡水珍珠价格下降，是珍珠市场混乱。没有力量抵抗我国加入WTO后国外强有力的珠宝企业对我国的珍珠市场的冲击。
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